На мотоциклы Honda CB400SF устанавливается механическая шестиступенчатая двухвальная коробка передач (КП) с ножным приводом переключения. Первая передача включается нажатием рычага вниз от «нейтрали», остальные передачи включаются переключением рычага вверх. В конструкции КП используется схема с постоянным зацеплением шестерен, при этом шестерни передач первичного вала закреплены на нем жестко, а шестерни вторичного вала вращаются на валу свободно и фиксируются на валу при помощи муфт переключения, тем самым замыкая поток мощности, передаваемый от двигателя к главной передаче.
Коробка передач сблокирована с двигателем и корзиной сцепления в едином картере и имеет общую систему смазки моторным маслом. Валы установлены в картере КП на роликовых и шариковых подшипниках.